微信小程序理论上是一个WebApp，是基于网络平台的应用，它不需要在设备上下载安装，比如现有微信里的摩拜单车，而独立的手机APP是专门针对某一类移动设备产生的，它们都是被直接安装到手机设备里，属于独立的应用，从推广成本来说，微信小程序的推广成本和公众号类似，要远远低于APP的推广成本。而独立手机APP更适合比较全面，无限制，最大发挥手机功能或者彰显品牌效果时候用的。
从技术上说，微信小程序开发就是微信支持的一种第三方插件的开发运用，微信向这种第三方插件开放了更多的功能接口，从丰富的界面控制到多种框架，特别合适提供了更多的对移动设备的访问能力。
而手机APP开发是一种完全独立的应用开发，它是直接基于手机的操作系统，在很底层的基础上开发的一个完整应用程序。这就导致了微信小程序开发的成本要比手机APP开发的成本低出来很多。
还记得微信小程序没有出现之前，是做一个APP还是做一个公众号，已经让APP创业者很纠结了，因为APP的开发流程漫长，获得用户的成本又很高，而做一个公众号更为轻量级，成本更低，所以许多创业公司选择了APP与公众号相辅相成的模式。但是从功用上看，小程序不同于公众号，它更像是App的轻量级简化版，嵌入在微信中实现本地化，直接将第三方应用与微信打通，不再像公众号那样只充当间接引流的作用，比如已经嵌入微信的滴滴打车，用户不需要下载滴滴打车APP，通过微信直接就可以打车，极大的缓解手机储存压力。所以小程序在很多方面优势是比较明显的。
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